1999年,京客隆和北京朝陽副食品批發總公司合并后,當時的京客隆副總經理高京生親自掛帥推進信息化項目,上了一套商業信息管理系統(MIS),主要是對配送中心流程進行規范化。2001年,由于連鎖店越開越多,京客隆配送中心的壓力也越來越大,原有的MIS系統中雖然有倉儲管理的模塊,但功能已經不足以支撐業務需求,于是,公司又引入了一套專業的物流系統(WMS)。2002年,“電子商務”的概念被炒得火熱,京客隆當年也進行了B to B方面的開發,至今仍在使用。京客隆對每個商品都設定了安全庫存量,如果現有庫存低于安全庫存,系統就自動生成訂單,并把這些信息發到網站上,供應商通過定期登陸京客隆的網站,下載訂單進行發貨。實際上,這在當時已經形成了一個供應鏈系統。在2004年到2005年期間,京客隆以MIS系統為核心,將結算系統獨立出來。到賬期之后,系統會自動把結算的單據發到網站上,廠家可以自行在京客隆網站下載結算信息進行對賬處理,保證了結算的及時性,形成了無障礙結算。